- Berdiri pada tanggal 07 November 1983, yang dibangun oleh Pemerintah Pusat di atas lahan dengan luas 10.000 m2. Sekolah ini berlokasi di Jalan Trikora Arfai II Kel. Anday, Kec. Manokwari Selatan, Kab. Manokwari - Papua Barat. Pada tahun 1986 sekolah ini meluluskan siswa/siswinya untuk pertama kalinya.
- Perubahan Nama Sekolah: Sekolah SMP Negeri 4 Manokwari sudah mengalami perubahan nama sebanyak 2 kali. berawal dari SMP Negeri 4 Manokwari kemudian berganti nama menjadi SMP Negeri 7 Manokwari, dan pada tahun 2016 sekolah mengalami perubahan nama dari SMP Negeri 7 Manokwari menjadi SMP Negeri 4 Manokwari hingga sekarang
- Riwayat Kepala Sekolah
b. M. Nanlohy (Tahun 1990 - 2006)
c. Suroto, S.Pd (Tahun 2006 - 2018)
d. Hendrik Demih, S.Th., MM. (Tahun 2018 - Sekarang)